作者 | 李陽(yáng)(美國(guó)俄亥俄州立大學(xué)博士后)
本人作為生物信息領(lǐng)域研究人員,積累的經(jīng)驗(yàn)不多,踩的坑倒是不少。
雖然閱歷有限,但是不吐不快。下面先列舉一下我所踩過(guò)的坑,拋個(gè)磚,歡迎大家補(bǔ)充和拍磚。現(xiàn)在開(kāi)始:
1. 攤子太大
做科研有點(diǎn)像美國(guó)總統(tǒng)選舉。如果總統(tǒng)候選人得到了48個(gè)州的支持,那么副總統(tǒng)候選人就一定要覆蓋剩余的兩個(gè)州,而不一定是支持率第二高的人選。
科研也是一樣。不同的測(cè)序技術(shù)、測(cè)序平臺(tái)、物種得到的數(shù)據(jù)的內(nèi)部特征都是各有差異的。
我們開(kāi)發(fā)的算法很難適用于所有數(shù)據(jù),除非你只在模擬數(shù)據(jù)上做實(shí)驗(yàn)。能夠適用于最廣泛數(shù)據(jù)的算法,毫無(wú)疑問(wèn),絕對(duì)是第一個(gè)占領(lǐng)市場(chǎng)的方法。
我們不用太雄心勃勃地硬碰硬。只需要在實(shí)驗(yàn)和觀察中,發(fā)現(xiàn)自己的算法最適用的數(shù)據(jù)即可。
至于本領(lǐng)域最主流的算法,我們與它的數(shù)據(jù)格式最好對(duì)接。
2. 完美主義
做科研是從地點(diǎn)A走到地點(diǎn)B,而不是把腳印踏遍整個(gè)土地。因此,在做實(shí)驗(yàn)的過(guò)程中,最重要的是走到實(shí)驗(yàn)的最后一步(評(píng)估)。
至于實(shí)驗(yàn)過(guò)程中出現(xiàn)的各種意外(例如:個(gè)別數(shù)據(jù)上的Bug),我們可以不予理睬。
等到在一部分?jǐn)?shù)據(jù)上走到最后一步后,再騰出手來(lái)處理出現(xiàn)Bug的數(shù)據(jù)。
3. 流程不清晰
多數(shù)人年輕的時(shí)候執(zhí)行力超強(qiáng),經(jīng)常腦海里還沒(méi)有清晰的思路,就開(kāi)始寫(xiě)代碼做實(shí)驗(yàn)了。
其實(shí)在動(dòng)手之前,最應(yīng)該做的事有三項(xiàng):選擇數(shù)據(jù)(不需要太多,但是要覆蓋盡可能多的測(cè)序技術(shù));選擇比較軟件(同樣不需要多,但是需要對(duì)軟件進(jìn)行分類(lèi),每一類(lèi)選擇一個(gè));完成評(píng)價(jià)體系的代碼。
有了評(píng)價(jià)體系,在調(diào)試算法和程序的過(guò)程中才有方向。
4. 沒(méi)有時(shí)間觀念
科研永遠(yuǎn)沒(méi)有盡頭,因此該妥協(xié)的時(shí)候就妥協(xié)。
隨著研究的深入,一定會(huì)發(fā)現(xiàn)新問(wèn)題,甚至新思路。請(qǐng)?jiān)试S自己把新的創(chuàng)意留給下一篇論文。
時(shí)間不等人,目前的項(xiàng)目一定要跟隨時(shí)間線(xiàn)按時(shí)完成每一個(gè)里程碑。
說(shuō)到這里,注意了:為了有效地將項(xiàng)目進(jìn)行下去,最好把項(xiàng)目拆分為一個(gè)個(gè)里程碑。
舉個(gè)例子:對(duì)于一篇論文,我們可以把它根據(jù)正文圖片進(jìn)行拆分,完成一張圖意味著完成這幅圖的制作、相關(guān)正文和附件的書(shū)寫(xiě)。
絞盡腦汁,只想到了這些,歡迎補(bǔ)充!
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